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今天给大家介绍的一篇文章题目为“Roles of m5C RNA Modification Patterns in Biochemical Recurrence and Tumor Microenvironment Characterization of Prostate Adenocarcinoma”（M5C RNA修饰模式在前列腺癌生化复发和肿瘤微环境角色塑造中的作用）。

引言

(资料图片仅供参考)

前列腺癌是第二大最常见的癌症与高风险的生化复发(BCR)的男性。近年来，5-甲基胞嘧啶(m5C)修饰作为RNA转录后调控的一个新层面引起了人们的广泛关注。因此，我们旨在研究m5C修饰调节因子在前列腺癌BCR(PRAD)中的潜在作用。

研究方法

图一：PRAD中m5C调节器的遗传变异。

(A)TCGA-PRAD队列中m5C调节因子的CNV频率。拷贝数放大，蓝点；拷贝数删除，粉点。

(B)在PRAD中17m5C调节因子在染色体上的CNV位置。

(C)在PRAD中CNV与m5C调节因子的基因表达之间的关联。

图二：基于17m5C调节器评估m5C修改模式。

(A)在PRAD组织和正常前列腺组织中 m5C 调节因子的基因表达。

(B)m5C调节因子的基因网络。

(C)基于m5C调节平均算法识别的m5C修改模式。

(D)聚类结果的CDF曲线。

(E)关于两种m5C修改模式之间区别的主成分分析。

(F)基于TCGA-PRAD队列的BCR数据的两种 m5C修饰模式的Kaplan-Meier生存分析。

(G)GSVA富集分析确定了两种m5C修饰模式之间不同的生物学过程和潜在途径。

图三：M5C修改模式的TME相关分析。

(A)基于ESTIMATE算法的两种m5C修饰模式中的肿瘤纯度，免疫评分，基质评分和ESTIMATE评分。

(B)进行ssGSEA以评估两种m5C修饰模式中不同免疫细胞的丰度。

图四：不同m5C修饰模式的免疫治疗特征。

(A)两种m5C修饰模式中免疫检查点的表达。

(B，C)基于TIDE分析的不同m5C修饰模式的预测免疫治疗反应率。

图五：TME与m5C橡皮TET2的关系。

(A)TET2表达与浸润性免疫细胞之间的相关性。

(B)临床样品中TET2的代表性IHC染色。

结论

在此，我们揭示了m5C修饰模式在PRAD BCR和TME多样性中的作用。基于不同修饰模式的m5C标记对PRAD BCR具有强大而独立的预后能力，可用于预测个体对免疫治疗的反应。我们对m5C基因修饰的全面分析可以为PRAD研究领域提供新的视角，并有助于未来对TME和免疫治疗的理解。

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